MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4b

Total Repeats: 2501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011991	CGGTC	2	10	51432	51441	0 %	20 %	40 %	40 %	222109163
1002	NC_011991	GCA	2	6	51517	51522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109163
1003	NC_011991	GTC	2	6	51550	51555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109163
1004	NC_011991	GTCG	2	8	51603	51610	0 %	25 %	50 %	25 %	222109163
1005	NC_011991	GCA	2	6	51637	51642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109163
1006	NC_011991	GTT	2	6	51709	51714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_011991	ACC	2	6	51781	51786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109164
1008	NC_011991	CAAG	2	8	51791	51798	50 %	0 %	25 %	25 %	222109164
1009	NC_011991	CCT	2	6	51870	51875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109164
1010	NC_011991	GGCA	2	8	51885	51892	25 %	0 %	50 %	25 %	222109164
1011	NC_011991	AAGCGA	2	12	51903	51914	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	222109164
1012	NC_011991	GAC	2	6	51970	51975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109164
1013	NC_011991	TCG	2	6	51993	51998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109164
1014	NC_011991	CG	3	6	51997	52002	0 %	0 %	50 %	50 %	222109164
1015	NC_011991	CCT	2	6	52032	52037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109164
1016	NC_011991	GC	3	6	52043	52048	0 %	0 %	50 %	50 %	222109164
1017	NC_011991	GAG	2	6	52102	52107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109164
1018	NC_011991	CAGA	2	8	52165	52172	50 %	0 %	25 %	25 %	222109164
1019	NC_011991	GC	3	6	52178	52183	0 %	0 %	50 %	50 %	222109164
1020	NC_011991	CGA	2	6	52188	52193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109164
1021	NC_011991	TGC	2	6	52194	52199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109164
1022	NC_011991	CGC	2	6	52232	52237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109164
1023	NC_011991	TAT	2	6	52335	52340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_011991	GATC	2	8	52355	52362	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1025	NC_011991	GCC	2	6	52388	52393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_011991	CCG	2	6	52453	52458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_011991	TC	3	6	52467	52472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_011991	CGG	2	6	52733	52738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_011991	AG	3	6	52746	52751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_011991	GAA	2	6	52930	52935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_011991	GATC	2	8	52969	52976	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_011991	AAT	2	6	53000	53005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_011991	ATC	2	6	53022	53027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_011991	GAT	2	6	53100	53105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_011991	GCC	2	6	53128	53133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_011991	TGA	2	6	53151	53156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_011991	CCGC	2	8	53157	53164	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1038	NC_011991	GTCA	2	8	53205	53212	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_011991	TCC	2	6	53232	53237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_011991	CGG	2	6	53269	53274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_011991	CCT	2	6	53289	53294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_011991	GCC	2	6	53313	53318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_011991	GGC	2	6	53335	53340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_011991	GC	3	6	53387	53392	0 %	0 %	50 %	50 %	222109165
1045	NC_011991	GCC	2	6	53472	53477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109165
1046	NC_011991	ACG	2	6	53481	53486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109165
1047	NC_011991	GCC	2	6	53625	53630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109165
1048	NC_011991	CAC	2	6	53651	53656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109165
1049	NC_011991	ATC	2	6	53658	53663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109165
1050	NC_011991	CGG	2	6	53702	53707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109165
1051	NC_011991	TTC	2	6	53847	53852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109165
1052	NC_011991	CAT	2	6	53867	53872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109165
1053	NC_011991	GGC	2	6	53880	53885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109165
1054	NC_011991	CAT	2	6	53915	53920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109165
1055	NC_011991	GCC	2	6	53927	53932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109165
1056	NC_011991	CTG	2	6	53953	53958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109165
1057	NC_011991	GGA	2	6	54065	54070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109165
1058	NC_011991	GCT	2	6	54091	54096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109165
1059	NC_011991	GCC	2	6	54150	54155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109165
1060	NC_011991	GGC	2	6	54209	54214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109165
1061	NC_011991	AG	3	6	54272	54277	50 %	0 %	50 %	0 %	222109165
1062	NC_011991	TGA	2	6	54288	54293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109165
1063	NC_011991	TCC	3	9	54305	54313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109166
1064	NC_011991	ATC	2	6	54320	54325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109166
1065	NC_011991	ACG	2	6	54384	54389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109166
1066	NC_011991	GCC	2	6	54413	54418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109166
1067	NC_011991	CGC	2	6	54475	54480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109166
1068	NC_011991	ACG	2	6	54501	54506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109166
1069	NC_011991	GCA	2	6	54527	54532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109166
1070	NC_011991	CGG	2	6	54544	54549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109166
1071	NC_011991	CCCG	2	8	54567	54574	0 %	0 %	25 %	75 %	222109166
1072	NC_011991	GC	3	6	54646	54651	0 %	0 %	50 %	50 %	222109166
1073	NC_011991	TCG	2	6	54711	54716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109166
1074	NC_011991	GGC	2	6	54731	54736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109166
1075	NC_011991	CGA	2	6	54753	54758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109166
1076	NC_011991	ATG	2	6	54785	54790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109166
1077	NC_011991	CTGG	2	8	54808	54815	0 %	25 %	50 %	25 %	222109166
1078	NC_011991	G	6	6	54827	54832	0 %	0 %	100 %	0 %	222109166
1079	NC_011991	CGG	2	6	54861	54866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109167
1080	NC_011991	CTC	2	6	54882	54887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109167
1081	NC_011991	TGT	2	6	54902	54907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109167
1082	NC_011991	ACG	2	6	54931	54936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109167
1083	NC_011991	GAC	2	6	55204	55209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109167
1084	NC_011991	CGGC	2	8	55230	55237	0 %	0 %	50 %	50 %	222109167
1085	NC_011991	ATCG	2	8	55260	55267	25 %	25 %	25 %	25 %	222109167
1086	NC_011991	AGG	2	6	55276	55281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109167
1087	NC_011991	GA	3	6	55326	55331	50 %	0 %	50 %	0 %	222109167
1088	NC_011991	GGT	2	6	55371	55376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109167
1089	NC_011991	TGA	2	6	55401	55406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109167
1090	NC_011991	CGTG	2	8	55410	55417	0 %	25 %	50 %	25 %	222109167
1091	NC_011991	CCAAG	2	10	55418	55427	40 %	0 %	20 %	40 %	222109167
1092	NC_011991	AGC	2	6	55466	55471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109167
1093	NC_011991	TGGCT	2	10	55493	55502	0 %	40 %	40 %	20 %	222109167
1094	NC_011991	CGC	2	6	55567	55572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109167
1095	NC_011991	GC	3	6	55575	55580	0 %	0 %	50 %	50 %	222109167
1096	NC_011991	GTCGAT	2	12	55618	55629	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222109167
1097	NC_011991	TG	3	6	55687	55692	0 %	50 %	50 %	0 %	222109167
1098	NC_011991	GGA	2	6	55698	55703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109167
1099	NC_011991	CGG	2	6	55718	55723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109167
1100	NC_011991	ACG	2	6	55799	55804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_011991	TGA	2	6	55806	55811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_011991	CG	3	6	55812	55817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_011991	CGTG	2	8	55853	55860	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_011991	CGT	2	6	55866	55871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_011991	GCC	2	6	55973	55978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109168
1106	NC_011991	TCC	2	6	56142	56147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109168
1107	NC_011991	GCCG	2	8	56179	56186	0 %	0 %	50 %	50 %	222109168
1108	NC_011991	GC	3	6	56243	56248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_011991	CGC	2	6	56283	56288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_011991	GCA	2	6	56391	56396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109169
1111	NC_011991	GC	3	6	56516	56521	0 %	0 %	50 %	50 %	222109169
1112	NC_011991	TGA	2	6	56533	56538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109169
1113	NC_011991	T	6	6	56769	56774	0 %	100 %	0 %	0 %	222109169
1114	NC_011991	CGAT	2	8	56885	56892	25 %	25 %	25 %	25 %	222109169
1115	NC_011991	ACTG	2	8	56926	56933	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_011991	TGG	3	9	56958	56966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_011991	CGAT	2	8	57052	57059	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_011991	TCT	2	6	57097	57102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_011991	TTC	2	6	57178	57183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_011991	ACCC	2	8	57194	57201	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1121	NC_011991	CGC	2	6	57232	57237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_011991	CG	3	6	57245	57250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_011991	CAC	3	9	57404	57412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109170
1124	NC_011991	GCC	2	6	57540	57545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109170
1125	NC_011991	CGA	2	6	57596	57601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109170
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1127	NC_011991	GGCC	2	8	57774	57781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_011991	GCA	2	6	57794	57799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_011991	CCAT	2	8	57825	57832	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_011991	CGA	2	6	57961	57966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_011991	ACG	2	6	58011	58016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_011991	TCT	2	6	58027	58032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_011991	ATT	2	6	58130	58135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_011991	CGA	2	6	58170	58175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1152	NC_011991	GGC	2	6	59245	59250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109171
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1163	NC_011991	CCCG	2	8	60218	60225	0 %	0 %	25 %	75 %	222109172
1164	NC_011991	ACG	2	6	60328	60333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1166	NC_011991	CTG	2	6	60382	60387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1252	NC_011991	GA	3	6	64495	64500	50 %	0 %	50 %	0 %	222109177
1253	NC_011991	GCCA	2	8	64613	64620	25 %	0 %	25 %	50 %	222109177
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1259	NC_011991	CG	3	6	64861	64866	0 %	0 %	50 %	50 %	222109178
1260	NC_011991	TC	3	6	64907	64912	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1266	NC_011991	CTTT	2	8	65168	65175	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1384	NC_011991	GCA	2	6	70593	70598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109182
1385	NC_011991	CAGG	2	8	70620	70627	25 %	0 %	50 %	25 %	222109182
1386	NC_011991	GTCG	2	8	70644	70651	0 %	25 %	50 %	25 %	222109182
1387	NC_011991	CCACA	2	10	70686	70695	40 %	0 %	0 %	60 %	222109182
1388	NC_011991	CGT	2	6	70755	70760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109182
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1400	NC_011991	TTC	2	6	71242	71247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1406	NC_011991	T	6	6	71550	71555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1407	NC_011991	GTGAT	2	10	71561	71570	20 %	40 %	40 %	0 %	222109183
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1492	NC_011991	CGT	2	6	76377	76382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1499	NC_011991	AG	3	6	76623	76628	50 %	0 %	50 %	0 %	222109189
1500	NC_011991	AG	3	6	76684	76689	50 %	0 %	50 %	0 %	222109189

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